研究探索SARS-CoV-2指數增長、高流行率及Delta相關疫苗有效性

發布日期:2021-12-24 瀏覽次數:380

來源: 生物谷 

盡管疫苗接種率很高,但是冠狀病毒SARS-CoV-2感染的流行繼續推動著發病率和住院率,在許多人群中,由這種病毒的Delta變體引起的病例比例在增加。隨著疫苗接種計劃在全球范圍內的展開和社交距離的放寬,SARS-CoV-2的未來趨勢并不確定。

自2020年5月以來,REACT-1(Real-time Assessment of Community Transmission–1)研究一直在跟蹤COVID-19大流行病在英格蘭的傳播。基于英格蘭5歲及以上人群的隨機樣本,該研究涉及每月2至3周內從約10萬人或更多人那里獲取自制的咽拭子和鼻拭子進行逆轉錄聚合酶鏈式反應(RT-PCR)檢測。除了拭子陽性的信息外,來自英國帝國理工學院等研究機構的研究人員還收集人口統計學和其他潛在風險因素的數據,以及(自2021年1月起)疫苗接種史。患病率估計值經過加權處理,以代表整個英格蘭的人口。在此,他們利用REACT-1第12輪(2021年5月20日至2021年6月7日之間)和第13輪(2021年6月24日至7月12日之間)的RT-PCR拭子陽性數據來分析流行趨勢及其驅動因素。回復率(response rate),即收到有效拭子結果的受邀者的百分比,在所有輪次中為20.4%,在第12輪和第13輪中分別為13.4%和11.7%。

這些研究人員觀察到,隨著英格蘭第三輪疫情的展開,再生數R在第12輪估計為1.44(95%可信區間為1.20,1.73),在第13輪為1.19(1.06,1.32),對應于第12輪和第13輪的平均翻倍時間分別為11天(7,23天)和25天(15,>50天)。這導致平均加權患病率從第12輪的0.15%(0.12%,0.18%)(基于108911個有效拭子中的135個陽性)增加到第13輪的0.63%(0.57%,0.69%)(98233個有效拭子中的527個陽性)。不同輪次之間和每輪次內的快速增長似乎是由Delta變體完全取代Alpha變體,以及在較年輕、較少接種疫苗的年齡組中的高流行率所驅動:在13至17歲的人群中,他們觀察到第12輪[0.16%(0.08%,0.31%)]和第13輪[1.56%(1.25%,1.95%)]之間加權流行率增加了9倍。在第13輪中,報告未接種疫苗者的加權患病率[1.21%(1.03%,1.41%)]比報告已接種兩劑疫苗者[0.40%(0.34%,0.48%)]高出3倍;然而,44%的感染發生在接種兩劑疫苗者身上,反映出盡管總體接種水平很高,但兩劑疫苗對感染的有效性仍不完善。

2021年期間,SARS-CoV-2變體替換導致感染上升,并引發了對疫苗抗感染有效性的擔憂。圖片來自Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551。

在18至64歲的參與者中,根據自我報告的疫苗接種情況,這些作者估計在第13輪中對感染的有效性(經年齡、性別、地區、種族和多重貧困指數調整)為49%(95%置信區間為22%,67%),如果只考慮強陽性[周期閾值(Ct)低于27],則上升到58%(33%,73%)。對于同一年齡組,他們估計對感染的有效性調整后為59%(23%,78%),即在檢測前一個月報告一種或多種常見的COVID-19癥狀(發燒、嗅覺或味覺喪失或改變、新的持續咳嗽)的人群中。除年齡外,種族、家庭規模和當地的貧困程度也共同導致了拭子陽性率較高的風險。

綜上所述,從2021年5月底至7月初,在英國開展了非常成功的疫苗接種運動,疫苗接種率很高,但在未接種疫苗的年輕人中,Delta變體的感染流行率較高,推動感染呈指數增長。盡管2021年夏季北半球的增長速度放緩(或流行率持平或下降),但在Delta變體存在的情況下,增加的混合可能解釋了2021年秋季發生的重新增長,即使是在疫苗接種水平較高的人群中。

注:原文有刪減

參考資料:

Paul Elliott et al. Exponential growth, high prevalence of SARS-CoV-2, and vaccine effectiveness associated with the Delta variant. Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551.

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